Όπως φαίνεται το λογότυπο του σπηλαίου είναι πρακτικά ολόιδιο με του Batman. Συγκεκριμένα είναι το λογότυπο από την ταινία του '89 με μόνη διαφορά ότι έχουν λειανθεί οι κάτω μύτες και... είναι πράσινο (χωρίς το οβάλ).
Σύμφωνα με δηλώσεις του στο VICE ο επιστημονικός διευθυντής του σπηλαίου Δρ. Νικόλαος Καρτάλης, οι υπεύθυνοι του σπηλαίου αποφάσισαν να υιοθετήσουν το παραπάνω λογότυπο το 1998, για να τιμήσουν την Ελληνική Σπηλαιολογική Εταιρία που ανακάλυψε το σπήλαιο το 1976, η οποία έχει στο λογότυπό της μία νυχτερίδα, το ζώο που συναντάνε πιο συχνά οι σπηλαιολόγοι.
Ενδιαφέρον έχει ότι αν και δεν μοιάζει ιδιαίτερα, το κίτρινο οβάλ εδώ υπάρχει, αν και η εταιρία και το λογότυπό της -προφανώς- προϋπάρχουν της ταινίας του Μπάρτον (αλλά όχι του Batman, μιας και ιδρύθηκε το 1950). Στην ερώτηση για την ομοιότητα του λογότυπου ο Δρ. Καρτάλης είπε ότι "Πρόκειται για ένα διεθνές αναγνωρισμένο logo [του σπηλαίου]. Τώρα, αν μοιάζει με αυτό που αναφέρετε, ίσως να προσελκύσει και τα μικρά παιδιά". Προφανώς δεν διάβαζε comics όταν ήταν μικρός...
